Se procedió a tomar las muestras en ocho puntos de monitoreo distribuidas en tres líneas: Línea Norte (Frente a Residencia Universitaria; Muelle isla Esteves, Isla Blanca). Línea Centro (Tercera Boya muelle Puno, Faro, Captación de agua potable). Línea Sur (Terminal terrestre, Muelle Espinar). En la superficie y profundidad. Se analizó la concentración de nutrientes como Fosforo, Nitrógeno.Para indicar la eutroficacion del agua se determinó parámetros químicos Oxígeno Disuelto (OD), demanada Bioquímica del Oxigeno (DBO5) Nitrógeno total (N-T) fosforo total (P-T) clorofila a, también se determinaron parámetros físicos (Temperatura (T°C), pH, solidos totales disueltos (STD), conductividad, turbidez). El periodo de monitoreo fue desarrollado desde el mes de Febrero a Setiembre del 2009.