Ecología y evolución: Ecología microbiana. Interacciones entre poblaciones: Evolución microbiana y biodiversidad; interacciones entre poblaciones microbianas; interacciones entre microorganismos y plantas; interacciones entre microorganismos y animales. Comunidades y ecosistemas microbianas: Desarrollo de las comunidades microbianas; ecología cuantitativa: número, biomasa y actividad; ecología fisiológica de los microorganismos; los microorganismos en sus hábitat naturales; ciclos biogeoquímicos: carbono, hidrógeno y oxígeno; nitrógeno, azufre, fósforo, hierro y otros elementos. Aspectos biotecnológicos de la ecología microbiana: Aspectos ecológicos en el control del biodeterioro y en la gestión de suelos, residuos y agua; interacciones microbianas con contaminantes xenobióticos e inorgánicos; ensayos de biodegradabilidad y seguimiento de la biorremediación de contaminantes xenobióticos; microorganismos en la recuperación de minerales y energía, y en la producción de combustible y biomasa; control microbiano de plagas y de poblaciones causantes de enfermedad.