La laguna Patococha está ubicada en la Ecoregión Puna alcanzando temperaturas ambientales mínimas anuales de 3°C y promedios anuales máximos de 8°C y el régimen de precipitación mensual varía desde menos de 5 mm en la época de estiaje hasta valores cercanos a 180 mm en la época de lluvias. La reducción de la precipitación en la época de estiaje trae consigo la disminución del nivel de la laguna quedando expuestas a la desecación las colonias de cushuro ubicadas en las partes marginales de la Laguna. En el presente trabajo se ha registrado una reducción significativa de la biomasa de la cianobacterias lo que estaría relacionado en parte el afloramiento copioso del helecho del genero Azolla que reduce la incidencia de la luz a las partes profundas de la Laguna.