La presente investigación tuvo como propósito determinar la influencia de la motivación aplicada en la gestión de recursos humanos en el desempeño laboral de los Trabajadores Administrativos del Instituto Nacional de Rehabilitación “Dra. Adriana Rebaza Flores” Amistad Perú – Japón. El estudio metodológicamente corresponde al tipo investigación aplicada de diseño no experimental transaccional y correlacional – causal.La muestra estuvo compuesta por 68 trabajadores administrativos (30 hombres y 38 mujeres), a quienes se les aplico una encuesta sobre la Motivación, y del análisis de documentos a través del Formato de Registro de Datos de las Fichas de Evaluación del Desempeño y Conducta Laboral. Se encontró que no existe relación estadísticamente significativa (p=0.603) entre motivación y desempeño laboral, lo que evidencia que la motivación no influye en el desempeño laboral de los trabajadores administrativos en el Instituto Nacional de Rehabilitación “Dra. Adriana Rebaza Flores”.Además, no se encontró influencia estadísticamente significativa entre motivación y el cumplimiento de funciones y obligaciones, lo que evidencia que los trabajadores cumplen sus funciones a pesar que presentan baja motivación. Sin embargo, su se encontró influencia significativa entre motivación y satisfacción laboral.